根霉的菌丝无隔膜、有分枝和假根，营养菌丝体上产生匍匐枝，匍匐枝的节间形成特有的假根，从假根处向上丛生直立、不分枝的孢囊梗，顶端膨大形成圆形的孢子囊，囊内产生孢囊孢子。

米根霉在分类上属于接合菌亚门(Zygomycota)，接合菌纲(Zygomycetes)，毛霉目(Mucorales)，毛霉科(Mucoraceae)，根霉属(Rhizopus)。菌落疏松或稠密，初呈白色，后变为灰褐色或黑褐色。菌丝匍匐爬行，无色。假根发达，分枝呈指状或根状，呈褐色。孢囊梗直立或稍弯曲，2-4株成束，与假根对生，有时膨大或分枝，呈褐色，长210-2500μm，直径5-18μm,囊轴呈球形或近球形或卵圆形，呈淡褐色，直径30-200μm.囊托呈楔型。孢子囊呈球形或近球形，老后呈黑色，直径60-250μm.孢囊抱子呈椭圆形、球形或其他形，呈黄灰色，直径5-8μm.有厚垣饱子，其形状、大小不一致，未见接合抱子。该菌于37-40℃能生长.

根霉在自然界分布很广，用途广泛，其淀粉酶活性很强，是酿造工业中常用糖化菌。我国早利用根霉糖化淀粉(即阿明诺法)生产酒精。根霉能生产延胡索酸、乳酸等有机酸，还能产生芳香性的酯类物质。根霉亦是转化甾族化合物的重要菌类。与生物技术关系密切的根霉主要有黑根霉、华根霉和米根霉。